Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ripply3Q924S9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ripply3Q924S9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ripply3Q924S9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms