Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp4Q921I6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp4Q921I6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp4Q921I6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp4Q921I6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms