Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FdpsQ920E5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FdpsQ920E5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FdpsQ920E5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FdpsQ920E5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FdpsQ920E5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FdpsQ920E5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FdpsQ920E5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FdpsQ920E5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FdpsQ920E5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FdpsQ920E5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FdpsQ920E5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms