Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SncbQ91ZZ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SncbQ91ZZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncbQ91ZZ3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SncbQ91ZZ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SncbQ91ZZ3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms