Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd3Q91WC0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd3Q91WC0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd3Q91WC0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd3Q91WC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Setd3Q91WC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd3Q91WC0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd3Q91WC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd3Q91WC0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd3Q91WC0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd3Q91WC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd3Q91WC0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd3Q91WC0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Setd3Q91WC0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setd3Q91WC0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Setd3Q91WC0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms