Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Klc3Q91W40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Klc3Q91W40 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Klc3Q91W40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Klc3Q91W40 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Klc3Q91W40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Klc3Q91W40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Klc3Q91W40 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Klc3Q91W40 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Klc3Q91W40 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms