Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ1

Gpn2, GPN-loop GTPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn2Q8VEJ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn2Q8VEJ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpn2Q8VEJ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpn2Q8VEJ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpn2Q8VEJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpn2Q8VEJ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms