Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE4

Rpa1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa1Q8VEE4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpa1Q8VEE4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpa1Q8VEE4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpa1Q8VEE4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpa1Q8VEE4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms