Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg8Q8VE18 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg8Q8VE18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg8Q8VE18 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg8Q8VE18 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg8Q8VE18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smg8Q8VE18 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smg8Q8VE18 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg8Q8VE18 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg8Q8VE18 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg8Q8VE18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg8Q8VE18 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smg8Q8VE18 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg8Q8VE18 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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