Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab3il1Q8VDV3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab3il1Q8VDV3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab3il1Q8VDV3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab3il1Q8VDV3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab3il1Q8VDV3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab3il1Q8VDV3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab3il1Q8VDV3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rab3il1Q8VDV3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab3il1Q8VDV3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3il1Q8VDV3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab3il1Q8VDV3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3il1Q8VDV3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3il1Q8VDV3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms