Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim29Q8R2Q0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim29Q8R2Q0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim29Q8R2Q0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim29Q8R2Q0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms