Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc5Q8K4Z2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fndc5Q8K4Z2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc5Q8K4Z2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc5Q8K4Z2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms