Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z0

Lgi2, Leucine-rich repeat LGI family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi2Q8K4Z0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lgi2Q8K4Z0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgi2Q8K4Z0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lgi2Q8K4Z0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lgi2Q8K4Z0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lgi2Q8K4Z0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lgi2Q8K4Z0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgi2Q8K4Z0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgi2Q8K4Z0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgi2Q8K4Z0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgi2Q8K4Z0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms