Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1eQ8K202 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1eQ8K202 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr1eQ8K202 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1eQ8K202 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms