Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfm1Q8K0D5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfm1Q8K0D5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfm1Q8K0D5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfm1Q8K0D5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfm1Q8K0D5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfm1Q8K0D5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfm1Q8K0D5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gfm1Q8K0D5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfm1Q8K0D5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gfm1Q8K0D5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfm1Q8K0D5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfm1Q8K0D5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gfm1Q8K0D5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfm1Q8K0D5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms