Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl1Q8CEQ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl1Q8CEQ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl1Q8CEQ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl1Q8CEQ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdkl1Q8CEQ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl1Q8CEQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl1Q8CEQ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms