Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm9955Q8CEJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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