Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc49a3Q8CE47 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc49a3Q8CE47 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc49a3Q8CE47 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc49a3Q8CE47 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms