Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
9030612E09RikQ8CE20 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
9030612E09RikQ8CE20 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms