Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc17Q8CE13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc17Q8CE13 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc17Q8CE13 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc17Q8CE13 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms