Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp11Q8CB67 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp11Q8CB67 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp11Q8CB67 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp11Q8CB67 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp11Q8CB67 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp11Q8CB67 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp11Q8CB67 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp11Q8CB67 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp11Q8CB67 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrp11Q8CB67 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrp11Q8CB67 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp11Q8CB67 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp11Q8CB67 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp11Q8CB67 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp11Q8CB67 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp11Q8CB67 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp11Q8CB67 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms