Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms