Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo48Q8CAT8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo48Q8CAT8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo48Q8CAT8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo48Q8CAT8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms