Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc15Q8C9M2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc15Q8C9M2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc15Q8C9M2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc15Q8C9M2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc15Q8C9M2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms