Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp20Q8C6M1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp20Q8C6M1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp20Q8C6M1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp20Q8C6M1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp20Q8C6M1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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