Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Camsap2Q8C1B1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Camsap2Q8C1B1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Camsap2Q8C1B1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Camsap2Q8C1B1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Camsap2Q8C1B1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Camsap2Q8C1B1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Camsap2Q8C1B1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Camsap2Q8C1B1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Camsap2Q8C1B1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Camsap2Q8C1B1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Camsap2Q8C1B1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Camsap2Q8C1B1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Camsap2Q8C1B1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Camsap2Q8C1B1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Camsap2Q8C1B1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Camsap2Q8C1B1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Camsap2Q8C1B1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Camsap2Q8C1B1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Camsap2Q8C1B1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Camsap2Q8C1B1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Camsap2Q8C1B1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Camsap2Q8C1B1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Camsap2Q8C1B1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Camsap2Q8C1B1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Camsap2Q8C1B1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Camsap2Q8C1B1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Camsap2Q8C1B1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Camsap2Q8C1B1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Camsap2Q8C1B1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.4 ms