Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfrp1Q8BXL7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfrp1Q8BXL7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfrp1Q8BXL7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms