Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Skor1Q8BX46 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Skor1Q8BX46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skor1Q8BX46 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Skor1Q8BX46 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skor1Q8BX46 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Skor1Q8BX46 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Skor1Q8BX46 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skor1Q8BX46 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skor1Q8BX46 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skor1Q8BX46 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skor1Q8BX46 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skor1Q8BX46 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skor1Q8BX46 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skor1Q8BX46 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms