Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl16Q8BSU2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl16Q8BSU2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl16Q8BSU2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl16Q8BSU2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl16Q8BSU2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms