Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.7 ms