Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hirip3Q8BLH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hirip3Q8BLH7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hirip3Q8BLH7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hirip3Q8BLH7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hirip3Q8BLH7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms