Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Usp54Q8BL06 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Usp54Q8BL06 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Usp54Q8BL06 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Usp54Q8BL06 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Usp54Q8BL06 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Usp54Q8BL06 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Usp54Q8BL06 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Usp54Q8BL06 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Usp54Q8BL06 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Usp54Q8BL06 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Usp54Q8BL06 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Usp54Q8BL06 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Usp54Q8BL06 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Usp54Q8BL06 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Usp54Q8BL06 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Usp54Q8BL06 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Usp54Q8BL06 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Usp54Q8BL06 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms