Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tubgcp5Q8BKN5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp5Q8BKN5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp5Q8BKN5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp5Q8BKN5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp5Q8BKN5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp5Q8BKN5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms