Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcal1Q8BJL0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcal1Q8BJL0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcal1Q8BJL0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcal1Q8BJL0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarcal1Q8BJL0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms