Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA3

Hmbox1, Homeobox-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmbox1Q8BJA3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmbox1Q8BJA3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmbox1Q8BJA3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmbox1Q8BJA3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmbox1Q8BJA3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmbox1Q8BJA3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmbox1Q8BJA3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmbox1Q8BJA3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms