Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmd4aQ8BIE6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmd4aQ8BIE6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd4aQ8BIE6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd4aQ8BIE6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd4aQ8BIE6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd4aQ8BIE6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmd4aQ8BIE6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd4aQ8BIE6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd4aQ8BIE6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmd4aQ8BIE6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms