Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmd3Q8BHD4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Frmd3Q8BHD4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmd3Q8BHD4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmd3Q8BHD4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms