Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc38a9Q8BGD6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc38a9Q8BGD6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc38a9Q8BGD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc38a9Q8BGD6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc38a9Q8BGD6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc38a9Q8BGD6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc38a9Q8BGD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 326.9 ms