Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.9 ms