Protein–RNA interactions for Protein: Q811W2

Cyp26b1, Cytochrome P450 26B1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26b1Q811W2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cyp26b1Q811W2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyp26b1Q811W2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp26b1Q811W2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cyp26b1Q811W2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp26b1Q811W2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp26b1Q811W2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cyp26b1Q811W2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms