Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfascQ810U3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NfascQ810U3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NfascQ810U3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfascQ810U3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms