Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q80Y73 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q80Y73 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q80Y73 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q80Y73 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q80Y73 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q80Y73 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q80Y73 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q80Y73 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q80Y73 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q80Y73 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q80Y73 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q80Y73 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q80Y73 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Q80Y73 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q80Y73 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q80Y73 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q80Y73 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q80Y73 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q80Y73 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q80Y73 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q80Y73 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q80Y73 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q80Y73 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q80Y73 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q80Y73 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q80Y73 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q80Y73 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q80Y73 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q80Y73 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q80Y73 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q80Y73 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q80Y73 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q80Y73 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q80Y73 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q80Y73 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q80Y73 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q80Y73 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q80Y73 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q80Y73 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q80Y73 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q80Y73 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q80Y73 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q80Y73 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q80Y73 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q80Y73 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q80Y73 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Q80Y73 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Q80Y73 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q80Y73 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q80Y73 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q80Y73 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q80Y73 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q80Y73 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q80Y73 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q80Y73 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q80Y73 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q80Y73 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q80Y73 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q80Y73 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q80Y73 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q80Y73 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q80Y73 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q80Y73 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q80Y73 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q80Y73 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q80Y73 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q80Y73 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q80Y73 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q80Y73 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q80Y73 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q80Y73 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q80Y73 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q80Y73 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q80Y73 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q80Y73 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q80Y73 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q80Y73 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q80Y73 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80Y73 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80Y73 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80Y73 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80Y73 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80Y73 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80Y73 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q80Y73 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q80Y73 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q80Y73 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q80Y73 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q80Y73 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Q80Y73 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q80Y73 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Q80Y73 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80Y73 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80Y73 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80Y73 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80Y73 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80Y73 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80Y73 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q80Y73 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms