Protein–RNA interactions for Protein: Q80XS6

Samd4b, Protein Smaug homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4bQ80XS6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd4bQ80XS6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samd4bQ80XS6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd4bQ80XS6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd4bQ80XS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms