Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp8Q80U87 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp8Q80U87 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp8Q80U87 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp8Q80U87 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms