Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

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Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CyldQ80TQ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CyldQ80TQ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CyldQ80TQ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CyldQ80TQ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CyldQ80TQ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CyldQ80TQ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CyldQ80TQ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CyldQ80TQ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CyldQ80TQ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CyldQ80TQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CyldQ80TQ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CyldQ80TQ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CyldQ80TQ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CyldQ80TQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms