Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctdp1Q7TSG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ctdp1Q7TSG2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms