Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek5Q7TSC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nek5Q7TSC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek5Q7TSC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek5Q7TSC3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms