Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPY9

Ldoc1, Protein LDOC1, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldoc1Q7TPY9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldoc1Q7TPY9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldoc1Q7TPY9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldoc1Q7TPY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldoc1Q7TPY9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldoc1Q7TPY9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms