Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14,35□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14,34□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14,33□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14,33□□□□□ -0,11
Mycbp2Q7TPH6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14,33□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14,33□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14,33□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14,32□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14,32□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14,31□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14,31□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14,31□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14,3□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14,29□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC14,29□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14,29□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14,28□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14,28□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14,28□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14,27□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14,27□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,12
Mycbp2Q7TPH6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14,27□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14,27□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14,26□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,26□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,26□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,26□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14,26□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,25□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14,25□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,25□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,25□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,24□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,24□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14,24□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC14,24□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,23□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,23□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,23□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC14,22□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14,22□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14,22□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14,22□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14,22□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14,22□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14,21□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,21□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14,21□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,21□□□□□ -0,13
Mycbp2Q7TPH6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14,21□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,21□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,2□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,2□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,2□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14,19□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,19□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,19□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14,19□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,19□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,18□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,17□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,17□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14,17□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,17□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14,16□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14,15□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14,15□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,15□□□□□ -0,14
Mycbp2Q7TPH6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,15□□□□□ -0,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms