Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HhipQ7TN16 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HhipQ7TN16 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HhipQ7TN16 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HhipQ7TN16 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HhipQ7TN16 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HhipQ7TN16 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms