Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GypcQ78HU7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GypcQ78HU7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GypcQ78HU7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GypcQ78HU7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GypcQ78HU7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GypcQ78HU7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms